SGK süreci 19 Şubat 2005’te SSK’nın Sağlık Bakanlığına devri ile başlar. İlk devir işlemi başlayıp SSK’lı hastaların "Özel Hastanelere ve serbest eczanelere" gitmeye başlamaları ile süreç başladı ve devam etti. SSK Sağlık İşleri kuruldu, gelen faturalar incelenip ödendi, bu süreç geçiş süreci olduğundan Bakanlık’ta toleranslı davrandı ve Ağustos 2008’e kadar devam etti. SSK Sağlık İşleri İl Müdürlükleri, SGK kurulduktan sonra SGK İl Müdürlüklerine bağlandı ve Merkez Müdürlükleri olarak adlandırıldı.
